突袭世界的大灾难“第二次冲击”后,世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他,却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下,特务机关NERV的葛成
成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣,变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗?2012年《福音战士新剧场版:Q》之后,这部动画讲述了被封印的故事的后续。
自幼感情极好的乙骨忧太与祈本里香约好长大后要结婚,却不料里香因死亡车祸化为强大怨灵依附在忧太身边,为此所苦的忧太一心求死,之后在五条悟的带领下进入咒术高专结识了新同学:禅院真希、狗卷棘与熊猫,他决定在